赣州市南康区人民检察院始于解放后1952年1月设立的的南康县人民检察署，公安局长兼检察长，干部2人，主要办理自侦案件。1954年检察署与公安局分开，独立行使检察权，内设一般监督侦查、审判监督和秘书，有干警9人。1955年1月检察署改称南康县人民检察院，内设批捕、起诉、自行侦查、监所劳改检察和秘书。“文化大革命”期间，检察工作先后由公安机关军事管制小组和县革命委员会保卫部负责。1978年10月恢复南康县人民检察院，干警6人。1980年院设审查批捕科、审查起诉科、经济检察科、法纪检察科和办公室，有干警21人。1982年增设监所检察科。1985年审查批捕、起诉两科合并为刑事检察科，全院干警35人。1994年，南康县人民检察院经济检察科更名为南康市人民检察院反贪污贿赂局。1995年南康撤县改市，南康县人民检察院更名为南康市人民检察院，同年，南康市人民检察院增设职务犯罪预防科。2003年，南康市人民检察院法纪检察科更名为南康市人民检察院反渎职侵权局。2014年南康撤市设区，南康市人民检察院更名为现今的赣州市南康区人民检察院。2018年反贪、反渎等职侦部门转隶至区监察委。2019年赣州市南康区人民检察院内设机构改革，设有9个内设机构，包含6个业务部门、2个综合部门、1个派出检察室。

　　南康检察院现有在编在岗干警46人（编制为51人），研究生学历干警7人，本科学历干警32人。党员干警32人，女干警16人。该院机构设置采用“6+2+1”模式，设有9个内设机构，包含6个业务部门，分别是第一检察部、第二检察部、第三检察部、第四检察部、第五检察部、综合业务部；2个综合部门，分别是办公室、政治部；1个派出检察室，即唐江检察室。

　　进入新时代，南康检察院坚持以习近平新时代中国特色社会主义思想为指导，讲政治、顾大局、谋发展、重自强，推进“四大检察”“十大业务”全面协调充分发展。以党建为抓手，抓班子带队伍，深化“两学一做”常态化教育，广泛开展“改作风、提效率、比业绩”活动，打造过硬检察队伍；聚焦检察职能，深化司法体制改革，强化业务提升，全方位开展法律监督工作，服务经济建设，助力打好三大攻坚战，维护社会公平正义；创新化解社会矛盾工作机制，全力推行案件“邮路巡访、办案人员回访、分管领导带案下访”案件三级递进同步访工作机制；开展“党员暨检察官主题活动日”，打造康检“工匠精神”文化建设品牌，引领干警不忘人民检察为人民的初心，牢记肩负的使命；创设“智慧康检云”平台，为智慧南康检察提供科技支撑。我院的各项建设有力地推动了检察工作向前发展，取得了优异成绩，受到上级机关和社会各界的好评。2016年以来，该院被高检院评为“全国文明接待示范窗口”和“全国基层民事行政检察工作先进基层院”；曾先后60余次受到上级党委、部门表彰，有100人次的干警获得评先、记功等表彰，涌现出“全国模范检察官”、“全省杰出检察官”、“全省检察业务专家”、全市“扫黑除恶先进个人”等一批先进典型。